Reparto:

• Zachary Levi como Toby Seville
• David Cross como Ian Hawke
• Jason Lee como David "Dave" Seville
• Wendie Malick como Doctora Rubin
• Anjelah Johnson como Julie Ortega
• Kevin Schmidt como Ryan Edwards
• Brando Eaton como Jeremy Smith
• Chris Warren Jr. como Xander
• Bridgit Mendler como Becca Kingston
• Kathryn Joosten como La tía Jackie Seville
• Bernard White como Doctor de Dave

Sinopsis:

Durante el Concierto en París de las ardillas, Dave sufre un grave accidente y va al hospital. Sobrevive, pero debe permanecer unos días para recuperarse así que deja a las ardillas con la tía de Dave (la tía Jackie), pero ella se cae de las escaleras y también va al hospital, así que su nieto Toby tiene que estar a cargo de ellos hasta que vuelva. Antes del evento, Dave había hecho arreglos para que Alvin, Simon y Theodore asistieran a la escuela secundaria. Lo que no sabe es que en su primer día las ardillas se sienten como "ardillas fuera del bosque" en la cuenta de todos los alumnos humanos alrededor.

Mientras tanto Ian Hawke, después de que las ardillas destrozaron su carrera, busca en el mundo de los animales a aquellos que puedan cantar y bailar. Encuentra a Brittany, Jeanette y Eleanor, las Chipettes o Arditas. Ellas le cantan la canción Put Your Records On. Ian las contrata y no puede esperar para que sean famosas y obtener su venganza jurada sobre las ardillas. Las Chipettes aceptan aunque no saben que Ian no tiene trabajo.

Un tiempo más tarde las ardillas son castigadas por una pelea contra los chicos humanos de su clase, pero la directora del instituto les propone olvidarse de lo que ha pasado si representan al instituto en un concurso musical y donan el premio al intituto en el caso de ganar; las ardillas aceptan. Al siguiente día, los chicos intentan desesperadamente no ir a clase, por lo que tratan de engañar sin éxito a Toby. Durante una clase de gimnasia en la que se lleva a cabo un juego de balón prisionero, Simón y Theodore son rápidamente eliminados de sendos pelotazos, pero Alvin logra librarse de un golpe mortal de Ryan, que es el quaterback del equipo de rugby del instituto y compañero de clases de Alvin. Interesado por la técnica natural de Alvin, Ryan se propone alistarle en el equipo, lo cual emociona a la ardilla y acepta. Becca Kingston, y sus otras compañeras descubren que van al instituto Alvin y las ardillas, y deciden visitarles, Alvin es el que besa el dedo de Becca Bridgit Mendler, y el que cuenta los chistes donde todas se rien. Bridgit solo deja el dedo para que Alvine lo bese, dice oh, y rie los chistes de Alvino...

Cuando Alvin, Simon y Theodore comienzan otro día de instituto, se encuentran con las Chipettes y se enamoran mutuamente, razón por la que están atontados a la hora de practicar. Pronto, se dan cuenta de que ellas están en el lado de Ian, que pretende usar a las chicas y el concierto musical para volver a su lujosa vida. Después las Chipettes cantan la canción Hot N Cold. Aunque la directora deja claro que prefiere a las Ardillas, de las cuales es una gran fan, los otros alumnos del instituto prefieren a las Chipettes, así que para decidir qué banda representará al instituto en el concurso musical las ardillas y las Chipettes deben competir en una Batalla musical de Bandas. El día del concurso Alvin asiste a un partido de fútbol americano mientras que las arditas cantan la canción Single Ladies (Put a Ring on It). Alvin llega tarde al concurso por lo cual las ardillas no cantaron y las arditas quedaron como representantes de la escuela en el concurso musical. Después de eso Alvin y Simon pelean pero después de salvar a Theodore de un águila de zoológico se reconcilian. El día en el que las arditas representarían la escuela, Ian les dice que arregló un concierto que ellas cantarían, ellas al querer representar la escuela, Ian las mete en una jaula, después Brittany llama a Alvin para que las salve. Alvin consigue una pequeña motocicleta y va en su búsqueda, mientras Simon les da instrucciones a las Arditas para abrir un candado de 3 dígitos; lo logran abrir y salen de la limusina en la que viajaban mientras Ian estaba ocupado. En ese momento Ian se entera de que trataban escapar y las Arditas saltan a la motocicleta que Alvin conducía, pero Ian los quiere atrapar. Alvin y las arditas saltan al helicóptero de juguete y le tiran sus cascos a Ian, haciendo que suelte el control; lo agarran y vuelven al concurso. Luego de que Toby cantara una canción vienen Alvin y Las Arditas y la directora presenta a las ardillas y las arditas y que cantarán juntos y ellos cantan We are family. Mientras que Ian sale perdiendo de nuevo en el concierto de las arditas. Así termina con las ardillas y las arditas en su hogar.